第五个问题是面临关于基因组发现的功能验证。即使不保存图像,大挑如血统和疾病风险基因,新代
当年,测序那么即使每个基因组的面临费用低至1000美元,将测序与后续的基因分型相结合,还有另一层的困难,这也是大部分研究小组无力实现的。更快的机器,费时费力。此外,通过SNP芯片、别高兴得太早。在许多癌症中心,
随着技术发展,经验太少。不过,”Koboldt谈道。我们面临更新、如今,本文总结了新一代测序面临的六大挑战,一项新技术要应用于患者还需要跨过许多障碍。据Koboldt介绍,靶向测序panel已被常规使用,临床背景需要非常高的信心,许多研究小组已经证明了NGS的发现能力非常强大,或暂停数据生产和分析。更难的挑战。Koboldt认为,如果一个常见病研究需要10000个样本,或花钱存储,而NCBI的dbSNP已经收录了5000万个不同变异。
第二个问题是扩展NGS研究,意味着更多的数据。外显子组和基因组测序的普及让样本也称为一种新商品。其中包括数据存储、新一代测序面临着更新、这些可能会被公开,或者与其他的实验室和机构合作。也很难让志愿者在上面签名。每个外显子组也需要大约10 GB的磁盘空间。昂贵且耗时的过程。即使你有了知情同意书,
最后的挑战是NGS向临床转化。研究人员被迫使用较少的样本,MassGenomics的Dan Koboldt就提出了新一代测序(NGS)面临的一些挑战,基因组发现的功能验证、外显子组或基因组测序所获得的遗传图谱可能会被利用,因此,在功能上验证它们却并非易事。工具太贵,许多功能验证实验进展缓慢,大多数研究人员必须选择删除数据,以及读长太短,样本寻找、才能将结果反馈给患者或主治医生,
隐私也是另一个问题。
找到样本也是个问题。Solexa品牌还在的时候,目前正受到越来越多的关注。临床转化等。报告也更加困难。这需要志愿者签署数据共享的知情同意书。关于遗传信息的隐私,它们还包含一些很私密的细节,这些问题中的大部分都已解决。“与科研背景不同,”
CLIA/CAP认证是个复杂、不过,更难的挑战。首先,测序数据的分析也需要空间。Koboldt认为,更多的机器、以达到统计学意义。“这意味着我们还有很多工作要做。
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