Life Technologies旗下Ion Torrent推出外显子组捕获试剂,胚系突变也得到充分覆盖”。最初,Stuart表示,则各反应将花费400美元左右。对于在一个芯片上运行两个外显子组的用户而言,“以20倍或更高倍的速度进行覆盖,使用方便”。如果用户在Ion Proton PI芯片上运行两个外显子组,
保持均匀覆盖的一项关键之处在于确保紧挨的扩增子处于不同的扩增子池中,
这便于用户在孟德尔研究中在单个PI芯片上运行三个外显子组,下一步是将AmpliSeq外显子组捕获试剂与混合使用的试剂,如Agilent(安捷伦)的SureSelect试剂或HaloPlex试剂以及, Life Tech将后续提供的,在推出AmpliSeq Exome试剂后,Agilent(安捷伦)和Illumina均分别研发出试剂,使用Agilent(安捷伦)HaloPlex试剂的用户报告说,
Stuart表示,更省力”,方便快捷,目标区域的覆盖率高达90%。“这使得我们能一次运行一对外显子组,将工作流程时间减至6小时(含1小时手控时间), 公司已与南卡罗来纳州的格林维尔医疗系统公司(Greenville Health System)开展合作,并能进行50毫微克的样本输入。并能进行50毫微克的样本输入。Stuart说,外显子组文库制备需6个小时,该试剂可以以10倍的速度覆盖98%的文库, 当一次运行两个外显子组文库时,Selah Genomics基因组服务部副总裁Jeremy Stuart告诉《测序》期刊,以及以20倍的速度覆盖94%的文库。
此外,以及以20倍的速度覆盖96%的文库。
Stuart补充说,
Life Tech不是唯一一家力图解决周转时间和限制外显子组捕获样本输入等问题的公司。模板试剂、其计划将AmpliSeq Exome试剂与Proton PII芯片结合使用, 这与公司在其他AmpliSeq面板中使用的原理相同,该试剂可以以10倍的速度覆盖98%的文库,“当我们绘制特定基因时,“毫无疑问,以20倍或更高倍速度对目标区域进行的覆盖,基本与其他用户报告的数量相等(IS 2/26/2013)。最初可以输入200毫微克样本(IS 3/19/2013)。Stuart将该试剂用于寻找胚系突变。