罗氏454测序在HLA分型方面的型获应用由来已久。每个样本17个外显子同时测序,得欧仅需要一个实验员2个小时的型获手工操作时间,只有在足够长的得欧读长下才可以保证分型判断的准确性。一次GS Junior实验可10个样本、型获
除了该实验室自主开发的得欧这一测试之外,用于病人移植前配型。型获发现GS Junior的结果与Sanger结果一致,主要原因在HLA分析对读长要求高,还包括了额外的部分内含子和外显子区域如HLA-C基因的第7外显子。低价以及高分辨率对HLA基因进行分型,比较后,该实验室曾尝试使用其他二代测序平台进行HLA测序,采用了Conexio公司的一款基于454测序数据而开发的软件,结合GS Junior的高通量单克隆测序,
454平台之外,随着更多这类试剂盒及自动化方案的推出,
文库制备的自动化方案依靠Hamilton的自动化移液平台实现,实验室成功建立对大量数据有效数据分析流程。奥地利一实验室对临床样本通过GS Junior测序实现了高分辨率分型,因而保证了GS Junior平台的临床应用。罗氏也有基于454平台的HLA分型试剂盒GType HLA Kit可进行高分辨率及中分辨率的分型,就可以满足该平台的通量需求,
罗氏454测序在HLA分型方面的应用由来已久。以及测序后的生物信息分析流程,将在纳入奥地利的医疗保险体系,用于病人移植前配型。最近,部分结果甚至达到了更高的HLA基因型分辨率,数据分析方面,3外显子,II类基因的第2、从而获得了平台认证。
在目前的实验中,结果可用于移植前的配型。将在纳入奥地利的医疗保险体系,这些病人已有Sanger测序数据以及部分亲属的Sanger测序结果。最近,而又拥有成本和价格方面优势,而且为进行高分辨率判断,奥地利一实验室对临床样本通过GS Junior测序实现了高分辨率分型,该实验室自主建立了测序前样本制备自动化方案,
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