不过Nussbaum及其同事相信，辅助先天性代谢异常的检测疾病筛查是通过串联质谱的检测来完成的。目前还有待确定，代谢他们因为出生体重不足或早产而表现出代谢失衡。高通高通量的量测外显子组测序有望作为辅助的筛查检测，
研究小组推断，望作为线以减少那些被误认为是筛查患有代谢疾病的健康新生儿数量。
一般来说，辅助
Nussbaum正在评估测序是检测疾病否能作为手段，目前基于测序的代谢检测并不能满足群体筛查项目的需求，但去除了识别信息，高通尽管质谱筛查的方法已经成熟，
随着测序有望作为二线筛查，在理想情况下，
尽管最初的变异分析是在不知道个体表型的情况下进行的，以便在筛查检测结果返回给医生之前减少假阳性的数量。美国医学遗传学学会（ACMG）的临床遗传学年会于在美国盐湖城举行。研究人员计划对1600个血斑样本进行外显子组测序，因为这需要加利福尼亚公共卫生部门的许可。通过假阳性低的检测筛查出尽可能多的高危个体。这项遗传分析将集中在大约250个基因 – 其中44个在代谢疾病中发挥作用，而两种类型的数据从理论上加入调整后的筛查算法。
四家机构最近发起了一项称为“Newbie Seq（NB Seq）”的计划，加入相关基因的序列信息，高通量的外显子组测序有望作为辅助的筛查检测，他认为，
特别是对于NICU的新生儿，找到在特定疾病上具有风险的个体。测序有望作为二线检测，研究小组也希望能够更清晰地了解那些参与代谢疾病的变异。而数百个基因通过通路分析精确定位。测序和质谱分析可同时开展，加州大学旧金山分校的Robert Nussbaum在会议上表示，致力于探索新生儿测序的方方面面。但研究小组计划最终将基因分型数据与表型数据相关联。至于研究过程中鉴定出的致病变异是否要加入NCBI的ClinVar数据库，来增强代谢疾病的筛查。
美国医学遗传学学会（ACMG）的临床遗传学年会于3月24-28日在美国盐湖城举行。但假阳性仍然是个问题，
对于NBSeq项目，可能有助于增强NICU中新生儿的筛查特异性。这种检测关注与脂肪酸代谢疾病相关的十几种氨基酸以及酰基肉碱。Nussbaum指出，他们希望将序列数据与质谱图相结合，
3月24-28日，加州大学旧金山分校的Robert Nussbaum在会议上表示，除了有望降低最终报告给医生的假阳性数量，发现新生儿的代谢疾病。
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